Hoy encontré el proyecto CoLinux, y en poco tiempo ya lo tengo corriendo en Windows 2000!!
La descripción del proyecto según el sitio oficial:
Cooperative Linux es el primer método funcionando, gratuito y de fuente abierta que permite correr Linux en Microsoft Windows de forma nativa.
Cooperative Linux es una adaptación del Kernel de Linux que le permite correr de forma cooperativa junto a otro sistema operativo en una misma computadora. Por ejemplo permite usar aplicaciones Linux en Windows/2000 sin requerir software de virtualización como VMWare.
En la imagen estoy usando firefox de Linux en mi escritorio Windows, y eso me permite hacer pruebas de compatibilidad de las aplicaciones sin tener que reiniciar el PC con Linux (dual boot).
Además, el proyecto andLinux tiene una versión de CoLinux que ya viene con un Ubuntu completamente configurado.